小米底金钱龟和大米底金钱龟的区别在于：

一、产地不同，从野生龟初始分布情况来看，小米底金钱龟一般分布在海南、广东等地区，大米底金钱龟一般分布在越南、广西等地区，但是人工培育后这种产地分布已经明显改变；

二、价格不同，目前市场大米底金钱龟的价格一般比小米底金钱龟贵；

三、体型不同，大米底金钱龟体型一般比小米底金钱龟大。